Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms