Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms