Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP5P82980 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP5P82980 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP5P82980 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP5P82980 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP5P82980 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP5P82980 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms