Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRB1P82279 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRB1P82279 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRB1P82279 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRB1P82279 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRB1P82279 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRB1P82279 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms