Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTNAP1P78357 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP1P78357 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP1P78357 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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