Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC1P78348 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms