Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HBG1P69891 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HBG1P69891 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HBG1P69891 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HBG1P69891 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms