Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-24P63145 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-24P63145 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-24P63145 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms