Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms