Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP46P62068 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP46P62068 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP46P62068 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP46P62068 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP46P62068 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP46P62068 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP46P62068 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP46P62068 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP46P62068 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms