Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-21P61565 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms