Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2FP61218 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms