Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP6P59044 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP6P59044 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms