Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA9P57773 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA9P57773 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA9P57773 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJA9P57773 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA9P57773 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA9P57773 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms