Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB25P57735 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB25P57735 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB25P57735 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB25P57735 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms