Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BACE1P56817 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BACE1P56817 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BACE1P56817 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BACE1P56817 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BACE1P56817 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BACE1P56817 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BACE1P56817 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms