Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX10P56693 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX10P56693 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX10P56693 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms