Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRPF1P55201 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRPF1P55201 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms