Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AFDNP55196 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFDNP55196 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFDNP55196 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFDNP55196 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFDNP55196 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms