Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YARSP54577 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YARSP54577 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YARSP54577 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YARSP54577 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YARSP54577 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YARSP54577 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms