Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms