Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THOP1P52888 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THOP1P52888 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
THOP1P52888 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
THOP1P52888 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
THOP1P52888 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
THOP1P52888 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
THOP1P52888 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms