Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms