Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCR4P51679 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCR4P51679 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCR4P51679 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCR4P51679 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCR4P51679 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCR4P51679 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCR4P51679 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCR4P51679 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCR4P51679 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCR4P51679 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCR4P51679 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCR4P51679 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCR4P51679 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms