Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC3P51654 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC3P51654 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPC3P51654 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC3P51654 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC3P51654 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC3P51654 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms