Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK7P50613 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK7P50613 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK7P50613 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK7P50613 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK7P50613 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms