Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX5P50542 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX5P50542 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX5P50542 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEX5P50542 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX5P50542 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX5P50542 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms