Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBP2P50120 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBP2P50120 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBP2P50120 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBP2P50120 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBP2P50120 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms