Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRIM1P49642 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRIM1P49642 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms