Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TTPAP49638 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTPAP49638 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTPAP49638 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTPAP49638 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TTPAP49638 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTPAP49638 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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