Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRIP1P48552 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms