Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA2P47869 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA2P47869 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms