Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS9P46781 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS9P46781 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS9P46781 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS9P46781 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS9P46781 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms