Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTRLP40313 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTRLP40313 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTRLP40313 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms