Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTBRP36941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBRP36941 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBRP36941 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBRP36941 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBRP36941 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBRP36941 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms