Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms