Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms