Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5C1P36542 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms