Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT9P35527 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT9P35527 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT9P35527 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT9P35527 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT9P35527 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT9P35527 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT9P35527 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT9P35527 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT9P35527 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT9P35527 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms