Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA4P35212 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms