Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms