Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms