Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms