Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA10P31260 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA10P31260 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms