Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRMP28827 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
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