Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBL1P28749 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBL1P28749 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBL1P28749 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms