Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTAFRP25105 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms