Protein–RNA interactions for Protein: P25038

IFM1, Translation initiation factor IF-2, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IFM1P25038 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 PAU11YGL261C 363 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 MRPL38YKL170W 417 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 RPF2YKR081C 1035 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 NDL1YLR254C 570 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 RPL6BYLR448W 531 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 PAU4YLR461W 363 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 RCE1YMR274C 948 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 YOL114CYOL114C 609 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 PEX5YDR244W 1839 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 TDA1YMR291W 1761 nt2.53□□□□□ -2
IFM1P25038 CWH41YGL027C 2502 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YJL049WYJL049W 1353 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 AVT5YBL089W 1380 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 NUM1YDR150W 8247 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 CAF120YNL278W 3183 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RPA12YJR063W 378 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PRM6YML047C 1059 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PDR17YNL264C 1053 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YGR067CYGR067C 2415 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SOK1YDR006C 2706 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PEX6YNL329C 3093 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 STN1YDR082W 1485 nt2.52□□□□□ -2.01
IFM1P25038 HFM1YGL251C 3564 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YKL222CYKL222C 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SPT14YPL175W 1359 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YMR046CYMR046C 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 VAC14YLR386W 2643 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SWR1YDR334W 4545 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 DPP1YDR284C 870 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YFH7YFR007W 1062 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MPP6YNR024W 561 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 APA1YCL050C 966 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MED1YPR070W 1701 nt2.51□□□□□ -2.01
IFM1P25038 GYP7YDL234C 2241 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PIB1YDR313C 861 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RRT13YER066W 558 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MAM1YER106W 909 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 COG7YGL005C 840 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YGL242CYGL242C 546 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SYS1YJL004C 612 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 LSM8YJR022W 330 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YLR365WYLR365W 333 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RPL20AYMR242C 519 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YOL162WYOL162W 648 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YOR277CYOR277C 309 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RPL33AYPL143W 324 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YBR090CYBR090C 369 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 ECM21YBL101C 3354 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SKO1YNL167C 1944 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 ESL2YKR096W 3588 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MUB1YMR100W 1863 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MET6YER091C 2304 nt2.5□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PSK1YAL017W 4071 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RPL13AYDL082W 600 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YDR133CYDR133C 336 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 FMN1YDR236C 657 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 GEP7YGL057C 864 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 MRPL9YGR220C 810 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 TDA8YAL064C-A 381 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SRT1YMR101C 1032 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YNL043CYNL043C 321 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PSD2YGR170W 3417 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
IFM1P25038 NOP56YLR197W 1515 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 TLC1TLC1 1301 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 IRA2YOL081W 9240 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 NRG1YDR043C 696 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RUB1YDR139C 234 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RPN9YDR427W 1182 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 DSE2YHR143W 978 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 POL32YJR043C 1053 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YKR033CYKR033C 426 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 INO4YOL108C 456 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 RRG7YOR305W 729 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YOR385WYOR385W 873 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 SWD3YBR175W 948 nt2.48□□□□□ -2.01
IFM1P25038 ILS1YBL076C 3219 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 DSE4YNR067C 3354 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 ROG1YGL144C 2058 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 FRE8YLR047C 2061 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 snR68snR68 136 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 PPH3YDR075W 927 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 GUK1YDR454C 564 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 HYP2YEL034W 474 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 YGR107WYGR107W 450 nt2.47□□□□□ -2.01
IFM1P25038 BAT1YHR208W 1182 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms