Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2AP24928 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms