Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB4P21439 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms